石墨炉原子吸收分光光度法和火焰原子吸收分光光度法都能检测样品中各元素的存在。

利用两种方法，几乎所有的元素都能测，如：Cu,Zn,Fe,Na,Mg,Cr,K,Ca等，不过检出限不同而已。

相对来说，石墨炉原子吸收分光光度法更是比火焰原子吸收分光光度法有着更多的优点。

第一，效率高：石墨炉的原子化效率接近100%，而火焰法的原子化效率只有1%左右。
第二，灵敏度高：用石墨炉进行原子化时，基态原子在吸收区内的停留时间较长。

相反，火焰原子吸收分光光度法也有着自身的优势。

火焰原子吸收分光光度法测定的元素比石墨炉原子吸收分光光度法多，进样量也比石墨炉大，分析速度大大提高。

就灵敏度方面，火焰原吸的检测是PPM级，石墨炉则是PPB级。有很多元素是火焰检测器原吸检测不出来的。
 

另外，石墨炉原子化程度高，可以测定固体及粘稠试样。

总结：

火焰原子化法的优点是：火焰原子化法的操作简便，重现性好，有效光程大，对大多数元素有较高灵敏度，因此应用广泛。

缺点是：原子化效率低，灵敏度不够高，而且一般不能直接分析固体样品。　　

石墨炉原子化器的优点是：原子化效率高，在可调的高温下试样利用率 达100%，灵敏度高，试样用量少，适用于难熔元素的测定。

缺点是：试样组成不均匀性的影响较大，测定精密度较低，共存化合物的干扰比火焰原子化法大，干扰背景比较严重，一般都需要校正背景。